ใช้ในการสังเคราะห์สารกลางทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนายาตระกูลทริปตามีนและยาอินโดล เป็นโครงสร้างพื้นฐานสำหรับโมเลกุลชีวภาพที่มีฤทธิ์ เช่น ตัวปรับตัวรับเซโรโทนินและสารต้านการอักเสบ ใช้ในงานวิจัยเพื่อเตรียมโพรบเรืองแสง เนื่องจากโครงสร้างอินโดลช่วยเพิ่มความไวในการตรวจจับในภาพถ่ายชีวภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยเกษตรเคมีเพื่อออกแบบสารควบคุมการเจริญเติบโตของพืชและยาฆ่าแมลงที่ใหม่ กลุ่มอัลดีไฮด์ช่วยให้สามารถปรับแต่งได้ง่าย ทำให้มีคุณค่าในเคมีคอมบิเนตอเรียลและการค้นพบยา