สารประกอบนี้ถูกนำมาใช้เป็นหลักในสาขาเคมียารักษาและการวิจัยทางเภสัชกรรม ในฐานะตัวสร้างที่หลากหลายสำหรับการสังเคราะห์โมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น โครงสร้างของมันซึ่งมีสารย่อยฮาโลเจนหลายตัว ทำให้เป็นสารกลางที่มีคุณค่าต่อการพัฒนาผู้สมัครยาที่มีศักยภาพ โดยเฉพาะอย่างยิ่งสำหรับโรคต่างๆ เช่น มะเร็ง การอักเสบ และโรคติดเชื้อ การมีกลุ่มโบรโม ฟลูออโร และไอโอโด ช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนทางเคมีแบบเลือกได้ ซึ่งช่วยให้ผู้วิจัยสามารถสำรวจความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรมและปรับปรุงกิจกรรมทางชีวภาพของสารประกอบสุดท้าย นอกจากนี้ ยังมักถูกใช้ในปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม เช่น ปฏิกิริยา Suzuki หรือ Buchwald-Hartwig เพื่อสร้างอนุพันธ์อินดาโซลที่หลากหลายที่มีการประยุกต์ใช้ทางรักษา บทบาทของมันในการพัฒนายับยั้งคินาสและตัวแทนที่กำหนดเป้าหมายเอนไซม์อื่นๆ ก็ควรกล่าวถึง เนื่องจากโครงสร้างอินดาโซลพบได้บ่อยในโมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ