7-Chloro-5-fluoro-1H-indazole เป็นสารเคมีที่มีการนำไปใช้ในด้านการวิจัยและพัฒนายา โดยเฉพาะในการออกแบบและสังเคราะห์สารประกอบใหม่ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ มักถูกใช้เป็นส่วนหนึ่งของกระบวนการค้นหายาที่มีศักยภาพในการรักษาโรคต่าง ๆ เช่น โรคมะเร็ง โรคติดเชื้อ และโรคทางระบบประสาท เนื่องจากโครงสร้างของมันสามารถทำหน้าที่เป็นโครงสร้างหลัก (scaffold) ในการปรับเปลี่ยนเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและความจำเพาะของยา นอกจากนี้ ยังอาจถูกนำไปใช้ในการศึกษากลไกการออกฤทธิ์ของยาและปฏิสัมพันธ์กับเป้าหมายทางชีวภาพในระดับโมเลกุลอีกด้วย