6-Methyl-1H-indazole-3-carboxylic acid ถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะอย่างยิ่งในกระบวนการพัฒนายาใหม่ๆ ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาต้านการอักเสบ ยาต้านมะเร็ง และยาที่มีผลต่อระบบประสาท สารนี้มักใช้เป็นสารตั้งต้นหรือสารกลางในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น ซึ่งมีศักยภาพในการออกฤทธิ์ทางยา นอกจากนี้ยังมีการศึกษาการนำไปใช้ในการพัฒนาสารเคมีที่มีคุณสมบัติในการต้านอนุมูลอิสระ และการป้องกันความเสียหายของเซลล์