6-Chloro-5-iodo-1H-indazole เป็นสารประกอบที่ใช้หลักในการวิจัยและพัฒนายาในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพหลากหลาย โครงสร้างของสารนี้มีคุณค่าต่อการสร้างสารประกอบที่เล็งเป้าไปยังเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะเจาะจง โดยเฉพาะในสาขามะเร็งวิทยา นักวิจัยมักใช้สารนี้ในการพัฒนายับยั้งที่อาจมีศักยภาพต่อโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับมะเร็ง โดยอาศัยแกนอินดาโซลที่มีฮาโลเจนเพื่อเพิ่มความสามารถในการจับและความเลือกเฉพาะ นอกจากนี้ ยังเป็นส่วนประกอบพื้นฐานในเคมียารักษาในการออกแบบตัวแทนบำบัดใหม่ โดยเฉพาะในการสำรวจยับยั้งคินาส ซึ่งมีความสำคัญในการควบคุมเส้นทางส่งสัญญาณในเซลล์ การประยุกต์ใช้ยังขยายไปสู่การศึกษาความผิดปกติทางระบบประสาท โดยช่วยในการพัฒนาสารประกอบที่ปรับการทำงานของสมอง โดยรวมแล้ว สารเคมีนี้มีบทบาทสำคัญในการส่งเสริมความก้าวหน้าของการค้นพบยาในหลายสาขาการรักษา