5,6-Dichloro-1H-indazole-3-carboxylic acid ถูกนำมาใช้หลักๆ ในงานวิจัยทางเภสัชวิทยา โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลที่ออกฤทธิ์ทางชีวภาพต่างๆ มีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนายับยั้งที่เล็งเป้าไปยังเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะเจาะจง สนับสนุนการสร้างตัวแทนบำบัดที่อาจเป็นไปได้ คุณสมบัติโครงสร้างของมันทำให้เหมาะสำหรับการดัดแปลง ช่วยให้สามารถสำรวจยาใหม่ในด้านต่างๆ เช่น มะเร็งวิทยา การอักเสบ และความผิดปกติทางเมแทบอลิซึม นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการศึกษาชีวเคมีเพื่อตรวจสอบปฏิสัมพันธ์โมเลกุลและเส้นทาง