4-Chloro-3-methyl-1H-indazole ใช้หลักในการวิจัยและพัฒนายา โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพหลากหลาย โครงสร้างแกนอินดาโซลของมันมีคุณค่าในการสร้างสารประกอบที่มีศักยภาพในการรักษา โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการพัฒนายับยั้งคินาส ซึ่งมีความสำคัญในการรักษามะเร็งและโรคอักเสบ นอกจากนี้ ยังถูกสำรวจในการออกแบบลิกานด์สำหรับการศึกษาตัวรับ ช่วยในการทำความเข้าใจเส้นทางสัญญาณเซลล์ ความหลากหลายของมันยังขยายไปถึงการวิจัยสารเคมีเกษตร ซึ่งมีส่วนช่วยในการพัฒนายาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชใหม่