3-Bromo-6-methyl-1H-indazol-5-amine ถูกนำมาใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารออกฤทธิ์ทางเภสัชวิทยา โดยเฉพาะในกระบวนการพัฒนายาต้านมะเร็งและยาต้านการอักเสบ เนื่องจากโครงสร้างทางเคมีที่เฉพาะเจาะจงของมัน ช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและความจำเพาะต่อเป้าหมายทางชีวภาพได้ นอกจากนี้ ยังมีการศึกษาการนำสารนี้ไปใช้ในการพัฒนาสารยับยั้งเอนไซม์บางชนิดที่มีบทบาทสำคัญในโรคทางระบบประสาทและโรคติดเชื้อ