3-BROMO-5,6-DIFLUORO-1H-INDAZOLE เป็นสารเคมีที่ใช้หลักในการวิจัยและพัฒนายา โดยเฉพาะในการสังเคราะห์สารประกอบยาใหม่ โครงสร้างที่มีทั้งตัวแทนโบรมีนและฟลูออรีนทำให้เป็นสารกลางที่มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ มักถูกนำมาใช้ในการออกแบบตัวยับยั้งที่เล็งเป้าไปยังเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะ โดยเฉพาะในบริบทของการบำบัดรักษามะเร็งและโรคทางระบบประสาท นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบหลักในเคมียารักษาเพื่อปรับปรุงคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์และเภสัชพลศาสตร์ของยาที่มีศักยภาพ แกนอินดาโซลที่ถูกฮาโลเจนแบบพิเศษนี้ยังพบการประยุกต์ใช้ในงานวิจัยเกษตรเคมีสำหรับพัฒนายาฆ่าแมลงหรือสารกำจัดวัชพืชใหม่