ใช้ในงานวิจัยด้านชีวเคมีเป็นหลัก โดยเฉพาะในการศึกษาเกี่ยวกับกลไกของเอนไซม์และเส้นทางการส่งสัญญาณภายในเซลล์ มีศักยภาพในการนำไปพัฒนาเป็นสารตั้งต้นสำหรับยารักษาโรค เนื่องจากโครงสร้างคล้ายกับสารที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพหลายชนิด เช่น สารต้านการอักเสบ และสารต้านมะเร็ง ยังมีการใช้ในห้องปฏิบัติการเพื่อสังเคราะห์สารอนุพันธ์ที่อาจมีคุณสมบัติทางเภสัชวิทยาที่ดีขึ้น รวมถึงการศึกษาโครงสร้าง-กิจกรรมของสารประกอบอินดาโซล