ใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะสารที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง และมีศักยภาพในการพัฒนาเป็นยารักษาโรคทางระบบประสาท เช่น โรควิตกกังวล ซึมเศร้า หรือโรคลมชัก พบว่าสารอนุพันธ์ของอินดาโซลมีฤทธิ์ยับยั้งการทำงานของเอนไซม์บางชนิด เช่น ฟอสโฟไรเลต ทำให้มีการศึกษาเพิ่มเติมเพื่อประยุกต์ใช้ในงานพัฒนายาต้านมะเร็ง รวมถึงใช้เป็นรีเอเจนต์ในปฏิกิริยาสังเคราะห์อินทรีย์เพื่อสร้างสารประกอบที่ซับซ้อนมากขึ้นในห้องปฏิบัติการ