ใช้ในงานวิจัยด้านเคมีอินทรีย์เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบอินดาโซลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในงานพัฒนายาที่เกี่ยวข้องกับการยับยั้งเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะเจาะจง เช่น ยาต้านมะเร็งหรือยาแก้อักเสบ หมู่โบรมีและไอโอดีนทำหน้าที่เป็นหมู่นำทางสำหรับปฏิกิริยาแทนที่แบบพาลาเดียม เช่น Suzuki coupling หรือ Heck reaction ซึ่งช่วยต่อเติมโครงสร้างสารให้มีความหลากหลายมากขึ้น นิยมใช้ในห้องปฏิบัติการวิจัยเพื่อสร้างสารต้นแบบ (lead compound) สำหรับทดสอบฤทธิ์ทางเภสัชวิทยา