6-Chloro-5-methyl-1H-indazole ถูกใช้หลักๆ ในสาขาเคมีทางการแพทย์เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพต่างๆ โครงสร้างของมันมักถูกนำไปรวมในการพัฒนายา โดยเฉพาะยาที่เล็งเป้าไปที่การยับยั้งเอนไซม์หรือการปรับเปลี่ยนตัวรับ สารนี้มีความน่าสนใจในการออกแบบยารักษาที่มีศักยภาพสำหรับภาวะเช่น การอักเสบ มะเร็ง และโรคทางระบบประสาท นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ ช่วยให้สร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้นสำหรับการวิจัยและการค้นพบยา ความหลากหลายและปฏิกิริยาของมันทำให้เป็นส่วนประกอบที่มีคุณค่าในการพัฒนาสารเคมีใหม่ที่มีการประยุกต์ใช้ทางบำบัด