3-Fluoro-1H-indazole เป็นสารเคมีที่ใช้หลักในการวิจัยและพัฒนายาเภสัชกรรมในฐานะสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพต่างๆ โครงสร้างของมันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการออกแบบยาตัวสมุครที่กำหนดเป้าหมายไปยังเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะ โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านมะเร็งและยาต้านการอักเสบ อะตอมฟลูออรีนในโมเลกุลช่วยเพิ่มความสัมพันธ์ในการจับและความเสถียรทางเมแทบอลิซึม ทำให้เป็นส่วนประกอบที่สำคัญในเคมียา นอกจากนี้ยังมีการศึกษาการใช้งานในด้านเคมีเภสัชกรรมเพื่อปรับปรุงคุณสมบัติทางเภสัชจลนศาสตร์ของยา เช่น การเพิ่มการดูดซึมและลดการเผาผลาญในร่างกาย ทำให้ยามีประสิทธิภาพมากขึ้นในการรักษาโรค นอกจากนี้ ยังมีการสำรวจในการสร้างสารประกอบเฮเทโรไซคลิกใหม่สำหรับการประยุกต์ใช้ทาง درمانیที่เป็นไปได้ รวมถึงโรคทางระบบประสาทและโรคติดเชื้อ ความหลากหลายของมันยังขยายไปถึงการวิจัยด้านเกษตรเคมี ที่ซึ่งอาจถูกนำมาใช้ในการพัฒนายาฆ่าแมลงหรือสารกำจัดวัชพืชใหม่