เปปไทด์ CCP ถูกใช้อย่างแพร่หลายในงานวิจัยชีวการแพทย์ โดยเฉพาะในการศึกษาโรคภูมิต้านตนเอง เช่น โรคข้ออักเสบรูมาตอยด์ (RA) มันทำหน้าที่เป็นเป้าหมายแอนติเจนหลักสำหรับการตรวจหาแอนติบอดี anti-CCP ซึ่งเป็นบิโอมาร์เกอร์ที่มีความจำเพาะสูงสำหรับการวินิจฉัยโรค RA ในระยะเริ่มต้น การนำไปใช้ในแอสเซย์วินิจฉัยช่วยเพิ่มความแม่นยำในการระบุโรคก่อนเกิดอาการรุนแรง ทำให้สามารถรักษาได้ทันเวลา นอกจากนี้ เปปไทด์ CCP ยังถูกใช้ในการพัฒนาและตรวจสอบอิมมูโนแอสเซย์ รวมถึง ELISA และการทดสอบเคมีหลอดแสง เพื่อวัดระดับแอนติบอดีในเซรุ่มของผู้ป่วย เนื่องจากมีความจำเพาะสูง จึงมีบทบาทสำคัญในการแยกแยะ RA จากภาวะข้ออักเสบจากสาเหตุอื่นๆ การวิจัยยังสำรวจศักยภาพของมันในการติดตามความก้าวหน้าของโรคและประเมินการตอบสนองต่อการรักษาในสถานการณ์ทางคลินิก