Imidazo[1,2-a]pyrimidine hydrochloride ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการวิจัยและพัฒนายาในวงการเภสัชกรรม เนื่องจากมีกิจกรรมทางชีวภาพที่หลากหลาย สารนี้ทำหน้าที่เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ตัวแทนบำบัดต่างๆ โดยเฉพาะอย่างยิ่งพวกนั้นที่มุ่งเป้าไปที่ความผิดปกติของระบบประสาทส่วนกลาง โครงสร้างของมันมักถูกนำเข้าไปในสารประกอบที่ออกแบบมาเพื่อรักษาอาการวิตกกังวล นอนไม่หลับ และภาวะทางระบบประสาทอื่นๆ เนื่องจากแสดงคุณสมบัติต้านวิตกกังวลและสงบประสาทที่มีศักยภาพ นอกจากนี้ ยังมีการสำรวจในการพัฒนายาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็ง ซึ่งอนุพันธ์ของมันแสดงกิจกรรมที่น่าจะเป็นไปได้ต่อสายพันธุ์ไวรัสเฉพาะและเซลล์มะเร็ง ในเคมียารักษา สารนี้มีคุณค่าในความสามารถในการปรับปรุงโปรไฟล์เภสัชจลนศาสตร์และเภสัชพลศาสตร์ของผู้สมัครยา ทำให้เป็นโครงสร้างพื้นฐานที่มีคุณค่าในการออกแบบยา