5-Chloro-8-iodoimidazo[1,2-c]pyrimidine นิยมใช้ในการวิจัยและพัฒนายา โดยเฉพาะในด้านเคมีเภสัชกรรม เนื่องจากโครงสร้างเฉพาะตัวที่สามารถนำไปปรับเปลี่ยนเพื่อสร้างสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพได้ มักใช้เป็นสารตั้งต้นหรือสารกลางในการสังเคราะห์สารประกอบใหม่ที่มีศักยภาพในการต้านมะเร็ง ต้านไวรัส หรือยับยั้งเอนไซม์เฉพาะทาง นอกจากนี้ ยังมีการศึกษานำไปใช้ในการพัฒนายาที่มีเป้าหมายในการรักษาโรคทางระบบประสาทหรือโรคติดเชื้ออีกด้วย