6-Bromo-2-methylimidazo[1,2-a]pyridine ถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีที่มีความสำคัญทางเภสัชวิทยา โดยเฉพาะในกระบวนการพัฒนายาต้านการอักเสบและยาต้านมะเร็ง สารนี้เป็นสารตั้งต้นที่สำคัญในการสร้างโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ ซึ่งสามารถนำไปศึกษาประสิทธิภาพและความเป็นพิษในเซลล์หรือสัตว์ทดลอง นอกจากนี้ ยังมีการนำไปใช้ในการวิจัยเพื่อพัฒนายาใหม่ๆ ที่มีกลไกการออกฤทธิ์เฉพาะเจาะจงต่อเป้าหมายทางชีวภาพ เช่น เอนไซม์หรือรีเซพเตอร์ที่เกี่ยวข้องกับโรคต่างๆ