3-Bromo-6-chloroimidazo[1,2-a]pyridine เป็นสารประกอบที่นำมาใช้หลักๆ ในงานวิจัยและพัฒนายา โดยเฉพาะในการสังเคราะห์โมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ สารนี้ทำหน้าที่เป็นตัวกลางสำคัญในการสร้างสารประกอบเฮเตอร์โรไซคลิกหลากหลายชนิด ซึ่งมักถูกสำรวจเพื่อคุณสมบัติทางรักษาที่มีศักยภาพ โครงสร้างของมันมีคุณค่าในเคมียารักษาเพื่อการออกแบบยารักษาที่มุ่งเป้าไปยังโรคเฉพาะเจาะจง เช่น มะเร็ง โรคติดเชื้อ และโรคทางระบบประสาท นอกจากนี้ ยังใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เพื่อสร้างโครงสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน ซึ่งช่วยในการพัฒนาสารเคมีใหม่ๆ ที่มีศักยภาพในการค้นพบยาและวิทยาศาสตร์วัสดุ