Imidazo[1,2-a]pyridin-2-ylmethanamine hydrochloride ถูกนำมาใช้หลักๆ ในสาขาเคมียาเพื่อพัฒนายาต่างๆ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ โดยเฉพาะอย่างยิ่งสำหรับโรคที่เกี่ยวข้องกับระบบประสาทส่วนกลาง โครงสร้างของมันมักถูกนำไปรวมในยาที่ออกแบบให้เป็นตัวปรับตัวรับ GABA-A ซึ่งมีความสำคัญในการรักษาโรคเช่น ความวิตกกังวล นอนไม่หลับ และโรคลมชัก นอกจากนี้ สารนี้ยังแสดงศักยภาพในการสร้างยาต้านการอักเสบและยาต้านจุลินทรีย์ ทำให้เป็นส่วนประกอบที่หลากหลายในการค้นคว้ายา นักวิจัยยังสำรวจการใช้ในการออกแบบยารักษาใหม่สำหรับมะเร็ง เนื่องจากความสามารถในการโต้ตอบกับเส้นทางเซลล์เฉพาะ รูปแบบ hydrochloride ช่วยเพิ่มความละลายน้ำ ทำให้ง่ายต่อการปรุงสูตรและการบริหารในสถานการณ์ทดลองและคลินิก