ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้ง kinase และยาแก้กังวล (anxiolytic agents) โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถดัดแปลงได้อย่างเลือกสรร ทำให้มีคุณค่าในเคมีทางการแพทย์สำหรับการสร้างโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ ใช้กันทั่วไปในปฏิกิริยาครอสคัปเปลิงเพื่อสร้างระบบเฮเทอโรไซคลิกที่ซับซ้อนซึ่งพบในผู้สมัครยา นอกจากนี้ยังใช้ในสถานที่วิจัยเพื่อพัฒนายาใหม่ที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง (CNS) เนื่องจากแกนอิมิดาโซพิริดีนมีความสัมพันธ์กับตัวรับเบนโซไดอะซีปีน