ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ โดยเฉพาะในเภสัชภัณฑ์ที่ขัดต่อระบบประสาทส่วนกลาง เป็นโครงสร้างพื้นฐานสำหรับพัฒนายับยั้ง kinase และยาลดความวิตกกังวล โครงสร้างฟลูออรีนช่วยเพิ่มความสัมพันธ์ในการจับและความเสถียรทางเมแทบอลิซึมในยาตัวสมัคร ใช้บ่อยในเคมียารักษาเพื่อศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรมเนื่องจากกรอบ heterocyclic ที่แข็งและความสามารถในการจับไฮโดรเจน นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนา PET radiotracers สำหรับการถ่ายภาพทางประสาท