ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในเภสัชกรรมที่มุ่งเป้าไปที่ตัวยับยั้ง kinase และสารต้านจุลชีพ โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถทำการปรับแต่งแบบเลือกสรรได้ ทำให้มีคุณค่าสำคัญในการค้นพบยาสำหรับสร้างโมเลกุลเบสอิมิดาโซพิริดีนที่มีศักยภาพต้านเนื้องอกและต้านการอักเสบ นอกจากนี้ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนาโพรบเรืองแสง เนื่องจากกลุ่มไนโตรและบรอมโมที่ดึงดูดอิเล็กตรอน ซึ่งช่วยเสริมคุณสมบัติทางโฟโตฟิสิกส์สำหรับการใช้งานด้านการตรวจจับ นิยมใช้ในขั้นตอนการสร้างสารนำร่อง (lead compound) สำหรับพัฒนายาใหม่ เนื่องจากโครงสร้างสามารถปรับแต่งได้ง่ายเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและความจำเพาะต่อเป้าหมายทางชีวภาพ และยังถูกใช้ในงานเคมีอินทรีย์เพื่อศึกษาการแทนที่ของหมู่ฟังก์ชันบนวงแหวนอิมิดาโซพิริดีน