เอทิล 6-ฟลูออโรอิไมดาโซ[1,2-a]ไพรีดีน-3-คาร์บ็อกซิเลต ถูกใช้หลัก ๆ ในงานวิจัยและพัฒนายาในฐานะสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพต่าง ๆ โครงสร้างของมันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการสร้างโมเลกุลที่มีศักยภาพในการรักษา เช่น ยาต้านการอักเสบ ยาต้านจุลินทรีย์ หรือยาต้านมะเร็ง แกนอิไมดาโซไพรีดีนของสารนี้มักถูกสำรวจเนื่องจากความสามารถในการโต้ตอบกับเป้าหมายทางชีวภาพ รวมถึงเอนไซม์และตัวรับ ทำให้เป็นส่วนประกอบที่หลากหลายในการค้นพบยา นอกจากนี้ การแทนที่ด้วยฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและความสัมพันธ์ในการจับ ซึ่งเป็นประโยชน์ในการปรับปรุงยาให้มีประสิทธิภาพและความปลอดภัยที่ดีขึ้น นักวิจัยยังศึกษาบทบาทของมันในการพัฒนาการรักษาใหม่สำหรับโรคทางระบบประสาท เนื่องจากศักยภาพในการผ่านกำแพงเลือด-สมอง