Imidazo[1,2-a]pyrazin-6-ylmethanamine dihydrochloride ถูกนำมาใช้ในงานวิจัยทางเภสัชวิทยาและพัฒนาการ โดยเฉพาะในการศึกษาสารยับยั้งบำบัดใหม่ สารนี้ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลที่กระตุ้นทางชีวภาพต่างๆ ซึ่งมักมุ่งเป้าไปที่เอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะที่เกี่ยวข้องกับเส้นทางการเจ็บป่วย คุณสมบัติโครงสร้างของมันมีคุณค่าในการออกแบบยาสำหรับภาวะต่างๆ เช่น มะเร็ง การอักเสบ และความผิดปกติของระบบประสาทส่วนกลาง นักวิจัยยังสำรวจศักยภาพของมันในการสร้างสารประกอบใหม่ที่มีประสิทธิภาพสูงขึ้นและผลข้างเคียงลดลง นอกจากนี้ ยังอาจใช้ในงานทดสอบทางชีวเคมีเพื่อศึกษาการโต้ตอบของโมเลกุลและกลไกการออกฤทธิ์