สารประกอบนี้ถูกนำมาใช้หลักๆ ในสาขาเคมีทางการแพทย์เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ โครงสร้างของมันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนายาที่มีศักยภาพในการรักษา โดยเฉพาะยาที่มุ่งเป้าไปยังโรคทางระบบประสาท นักวิจัยใช้แกน imidazopyrazine ของมันในการออกแบบสารประกอบที่โต้ตอบกับตัวรับเฉพาะในสมอง เช่น ตัวรับ GABA ซึ่งเกี่ยวข้องกับความวิตกกังวล โรคลมชัก และโรคนอนไม่หลับ นอกจากนี้ กลุ่ม tert-butyl และ methyl ester ให้ความยืดหยุ่นสำหรับการดัดแปลงทางเคมีเพิ่มเติม ทำให้สามารถสร้างอนุพันธ์ที่มีคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ที่เหมาะสมแล้ว สารเคมีนี้ยังถูกสำรวจในการพัฒนาตัวยับยั้งเอนไซม์ที่เกี่ยวข้องกับเส้นทางของโรค ทำให้เป็นส่วนประกอบพื้นฐานที่สำคัญในความพยายามค้นพบยา