ใช้หลักๆ เป็นของเหลวไอออนิกในงานประยุกต์ทางไฟฟ้าเคมี เนื่องจากความเสถียรทางความร้อนสูงและการนำไอออนิก ใช้บ่อยในแบตเตอรี่และตัวเก็บประจุเป็นส่วนประกอบของอิเล็กโทรไลต์ นอกจากนี้ยังใช้เป็นตัวทำละลายหรือตัวรองรับตัวเร่งปฏิกิริยาในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยาที่ต้องการสภาพแวดล้อมโพลาร์แบบไม่ใช้น้ำ ไอออนเพอร์คลอเรตช่วยเพิ่มความเสถียรต่อการออกซิเดชัน ทำให้เหมาะสำหรับระบบแรงดันไฟฟ้าสูง นอกจากนี้ยังมีการสำรวจใช้ในกระบวนการแยกไอออนโลหะและในโครงการเคมีสีเขียวเป็นสื่อปฏิกิริยาที่นำกลับมาใช้ใหม่ได้