ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านเชื้อราและยาต้านไวรัส ความตอบสนองของสารนี้ช่วยในการนำโครงสร้างแหวนอิมิดาโซลเข้าไปในโมเลกุลขนาดใหญ่ ซึ่งเป็นคุณสมบัติโครงสร้างหลักในสารประกอบชีวภาพหลายชนิด นิยมใช้ในการเตรียมตัวยาขัดขวางตัวรับฮิสตามีน H2 และยาอื่นๆ ที่มีโครงสร้างเฮเตอร์โรไซคลิกที่มีไนโตรเจน นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตรสำหรับสร้างส่วนผสมออกฤทธิ์ในผลิตภัณฑ์ป้องกันพืช กลุ่มคลอโรเมทิลของสารนี้ช่วยอำนวยความสะดวกในการเกิดปฏิกิริยาอัลคิลเลชัน ทำให้มีคุณค่าต่อการสังเคราะห์อินทรีย์และการวิจัยทางเคมียา นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านชีวเคมีเพื่อทำหน้าที่เป็นตัวเชื่อม (linker) หรือตัวดัดแปลงโมเลกุลในโปรตีนหรือเปปไทด์