4-คลอโร-2-ฟลูออโรฟีนิลไฮดราซีน ไฮโดรคลอไรด์ ใช้หลักในการสังเคราะห์สารประกอบเฮเทอโรไซคลิกต่าง ๆ โดยเฉพาะในการพัฒนายาและสารเคมีเกษตร มันทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการผลิตส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ที่กำหนดเป้าหมายไปยังเส้นทางชีวภาพเฉพาะเจาะจง บทบาทของมันในการก่อตัวของอนุพันธ์ไฮดราซอนทำให้มีคุณค่ากในการสร้างสารประกอบที่มีศักยภาพต้านการอักเสบ ต้านจุลินทรีย์ หรือต้านมะเร็ง นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในงานวิจัยสำหรับการพัฒนาสารเคมีใหม่ ๆ และในการศึกษากลไกปฏิกิริยาที่เกี่ยวข้องกับอนุพันธ์ไฮดราซีน การประยุกต์ใช้ของมันยังขยายไปสู่ศาสตร์วัสดุศาสตร์ ซึ่งใช้ในการเตรียมโพลิเมอร์เฉพาะทางและสีย้อม