2,5-Difluorophenylhydrazine ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในอุตสาหกรรมเคมีเพื่อเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ที่มีฟลูออรีนเป็นส่วนประกอบ โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตยาและสารเคมีทางการเกษตร เนื่องจากโครงสร้างที่มีฟลูออรีนช่วยเพิ่มประสิทธิภาพและความเสถียรของผลิตภัณฑ์ขั้นสุดท้าย นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยและพัฒนายาเพื่อสร้างโมเลกุลใหม่ที่มีศักยภาพในการรักษาโรคต่าง ๆ รวมถึงใช้ในการผลิตสีย้อมและสารเคมีเฉพาะทางอื่น ๆ ที่ต้องการคุณสมบัติเฉพาะของฟลูออรีน