1-Boc-2-isopropylhydrazine ใช้เป็นสารตั้งต้นในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการเตรียมยาและสารเคมีละเอียด มันทำหน้าที่เป็นอนุพันธ์ไฮดราซีนที่ได้รับการป้องกัน ซึ่งช่วยให้สามารถควบคุมปฏิกิริยาในการสังเคราะห์โมเลกุลที่ซับซ้อนได้ กลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) ให้ความเสถียรและป้องกันปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์ระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ สารประกอบนี้มักใช้ในการพัฒนาสารประกอบเฮเตอร์โรไซคลิก ซึ่งมีความสำคัญในด้านการค้นพบยาและเคมียารักษา การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงการสังเคราะห์โมเลกุลที่ออกฤทธิ์ทางชีวภาพ รวมถึงตัวแทนบำบัดที่อาจใช้ในการรักษาโรคต่าง ๆ นอกจากนี้ ยังใช้ในการเตรียมสารกลางสำหรับยาฆ่าแมลงและสารเคมีพิเศษอื่น ๆ