(4-Chloro-3-(trifluoromethyl)phenyl)hydrazine hydrochloride ใช้หลักในการสังเคราะห์สารกลางทางเภสัชกรรมและส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ต่างๆ ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบหลักในการพัฒนาสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในการสร้างสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง เนื่องจากความสามารถในการนำกลุ่มฟังก์ชันเฉพาะเข้าไปในโมเลกุลเป้าหมาย นอกจากนี้ ยังใช้ในการวิจัยเคมีอินทรีย์สำหรับการเตรียมอนุพันธ์ไฮดราซีน ซึ่งมีคุณค่าในการศึกษาปฏิกิริยาเคมีและกลไกการเกิดปฏิกิริยา บทบาทของมันในการผลิตสีย้อมและเม็ดสีก็สำคัญเช่นกัน เนื่องจากช่วยในการพัฒนาสารให้สีที่มีคุณสมบัติเฉพาะ