3,5-Difluorobenzhydrazide ถูกนำมาใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับการสร้างโครงสร้างเคมีที่ซับซ้อนมากขึ้น การประยุกต์ใช้รวมถึงบทบาทของมันเป็นสารกลางในการพัฒนายา โดยเฉพาะในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีศักยภาพทางชีวภาพ การมีอะตอมฟลูออรีนในโครงสร้างช่วยเพิ่มความสามารถในการโต้ตอบกับเป้าหมายทางชีวภาพ ทำให้มีคุณค่าสำคัญในการค้นพบยาและเคมียารักษา นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการเตรียมสารเคมีเกษตร ซึ่งอนุพันธ์ของมันสามารถแสดงคุณสมบัติกำจัดศัตรูพืชหรือกำจัดวัชพืช สารประกอบนี้ยังถูกสำรวจในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับการพัฒนาวัสดุขั้นสูงที่มีคุณสมบัติอิเล็กทรอนิกส์หรือคุณสมบัติทางแสงเฉพาะ ความตอบสนองและกลุ่มฟังก์ชันของมันทำให้เป็นตัวเร่งที่มีประโยชน์ในการแปลงเคมีต่างๆ สนับสนุนการสังเคราะห์สารประกอบใหม่ในงานวิจัยและการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรม