ไซยาโนอะซิโตไฮดราซิดถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะส่วนประกอบพื้นฐานที่หลากหลายสำหรับการเตรียมสารประกอบเฮเทอโรไซคลิกต่างๆ มันทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่มีคุณสมบัติต้านจุลินทรีย์ ต้านไวรัส และต้านมะเร็ง นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการผลิตสารเคมีเกษตร รวมถึงยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช เนื่องจากความสามารถในการสร้างอนุพันธ์ที่เสถียรและมีกิจกรรมทางชีวภาพ ในด้านวิทยาศาสตร์วัสดุ ไซยาโนอะซิโตไฮดราซิดถูกใช้ในการสังเคราะห์โพลิเมอร์และสีย้อม ซึ่งมีส่วนช่วยในการพัฒนาวัสดุขั้นสูงที่มีคุณสมบัติทางแสงและทางกลเฉพาะ ความสามารถในการทำปฏิกิริยากับสารประกอบคาร์บอนิลยังทำให้มันมีคุณค่าการในการสร้างเบสชิฟฟ์ ซึ่งมีการประยุกต์ใช้ในเคมีเชิงประสานและการเร่งปฏิกิริยา