ใช้ในอุตสาหกรรมโลหะสำหรับการทำความสะอาดผิวโลหะ โดยช่วยขจัดคราบออกไซด์และสนิมก่อนการชุบโลหะหรือเคลือบสี นิยมใช้ในอุตสาหกรรมอาหารและเครื่องดื่ม โดยเฉพาะเครื่องดื่มอัดลม เพื่อเพิ่มความเปรี้ยวและปรับค่าความเป็นกรด ใช้เป็นสารตั้งต้นในการผลิตปุ๋ยฟอสเฟต ซึ่งสำคัญต่อการเจริญเติบโตของพืช นำไปใช้ในอุตสาหกรรมผลิตผงซักฟอกและสารทำความสะอาดต่างๆ เนื่องจากมีความสามารถในการจับไอออนโลหะ ใช้ในงานด้านการแพทย์และทันตกรรม เช่น ใช้กรดฟอสฟอริกในการเตรียมผิวฟันก่อนอุดฟันหรือติดวัสดุทันตกรรม นอกจากนี้ยังใช้ในระบบบัฟเฟอร์ของสารละลายในห้องปฏิบัติการและอุตสาหกรรมยา