เมทาเนซัลโฟนิกแอซิดถูกใช้อย่างกว้างขวางเป็นตัวเร่งปฏิกิริยาแบบกรดในสังเคราะห์อินทรีย์ เนื่องจากมีความเป็นกรดสูงและละลายได้ดีในตัวทำละลายอินทรีย์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีคุณค่าต่อการเกิดปฏิกิริยาเอสเทอร์รีฟิเคชัน อัลคิเลชัน และพอลิเมอไรเซชัน ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม ทำหน้าที่เป็นสารเคมีหลักในการผลิตส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) และสารกลาง การนำไปใช้ในกระบวนการชุบโลหะด้วยไฟฟ้าและการขึ้นรูปโลหะมีความสำคัญ เนื่องจากให้สารละลายอิเล็กโทรไลต์ที่เสถียรและมีประสิทธิภาพสำหรับการสะสมโลหะ เช่น ดีบุก ตะกั่ว และโลหะผสมดีบุก-ตะกั่ว นอกจากนี้ ยังใช้ในการผลิตสารเคมีพิเศษ เช่น สารลดแรงตึงผิวและสีย้อม ซึ่งคุณสมบัติของมันช่วยเพิ่มประสิทธิภาพการเกิดปฏิกิริยา ความเป็นพิษต่ำและย่อยสลายได้ทางชีวภาพทำให้เป็นตัวเลือกที่เหมาะสมในงานที่ละเอียดอ่อนต่อสิ่งแวดล้อม