H3B-120 ใช้หลักๆ ในสาขาเคมีทางการแพทย์และการพัฒนายา มันทำหน้าที่เป็นตัวยับยั้งที่แรงและเลือกสรรเฉพาะของเอนไซม์ histone methyltransferase ชื่อ DOT1L ซึ่งมีบทบาทสำคัญในการควบคุมการแสดงออกของยีน โดยการยับยั้ง DOT1L H3B-120 ถูกใช้ในการวิจัยเพื่อศึกษาผลกระทบของการดัดแปลง epigenetic ต่อการลุกลามของมะเร็ง โดยเฉพาะในมะเร็งเม็ดเลือดขาว เช่น mixed lineage leukemia (MLL) การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงการศึกษาก่อนคลินิก ซึ่งช่วยในการทำความเข้าใจศักยภาพทางรักษาของการกำหนดเป้าหมาย DOT1L สำหรับการรักษามะเร็งที่ขับเคลื่อนโดยการจัดเรียงยีน MLL นอกจากนี้ H3B-120 ยังถูกใช้ในการพัฒนาการบำบัด epigenetic ใหม่ๆ โดยให้ข้อมูลเชิงลึกในการออกแบบตัวยับยั้งที่มีประสิทธิภาพและเฉพาะเจาะจงมากขึ้นสำหรับการใช้ทางคลินิก