SET 2 ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการวิจัยด้าน epigenetics เนื่องจากบทบาทของมันในฐานะตัวยับยั้ง histone methyltransferase มันเลือกเป้าหมายโปรตีนที่มีโดเมน SET โดยเฉพาะ ซึ่งมีส่วนเกี่ยวข้องกับการเมทิลเลชันของไลซีนบนหาง histone โดยเฉพาะ H3K9 และ H3K27 โดยการยับยั้งเอนไซม์เหล่านี้ SET 2 ช่วยปรับเปลี่ยนรูปแบบการแสดงออกของยีน ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าในการศึกษาความเคลื่อนไหวของโครมาตินและกลไกการปิดกั้นยีน

ในการวิจัยมะเร็ง SET 2 แสดงศักยภาพในการกระตุ้นยีนยับยั้งมะเร็งที่ถูกปิดกั้นผ่านการเมทิลเลชัน histone ที่ผิดปกติ มันถูกนำมาใช้ในโมเดลเซลล์ของมะเร็งเม็ดเลือดขาว มะเร็งเต้านม และมะเร็งชนิดอื่นๆ เพื่อประเมินผลกระทบของการปรับเปลี่ยน epigenetics ต่อการเพิ่มจำนวนเซลล์และ apoptosis นอกจากนี้ SET 2 ยังถูกใช้ในการศึกษาความเป็นสเต็มเซลล์เพื่อมีอิทธิพลต่อเส้นทางการแยกตัวโดยการเปลี่ยนแปลงภูมิทัศน์ epigenetics

การประยุกต์ใช้ของมันขยายไปสู่การวิจัยโรคเสื่อมถอยของระบบประสาท ซึ่ง dysregulation epigenetics มีบทบาท SET 2 ช่วยตรวจสอบว่าการเมทิลเลชัน histone ส่งผลกระทบต่อการแสดงออกของยีนในเซลล์ประสาทและ synaptic plasticity อย่างไร เนื่องจากความสามารถในการซึมผ่านเซลล์และความเสถียรสัมพัทธ์ มันเหมาะสำหรับระบบทดลอง in vitro และ ex vivo สนับสนุนการคัดกรอง high-throughput สำหรับการบำบัด epigenetics ใหม่