EPZ031686 ถูกนำมาใช้หลักๆ ในงานวิจัยทางวิทยาศาสตร์ในฐานะตัวยับยั้งเอนไซม์ EZH2 ที่มีประสิทธิภาพสูงและเลือกสรร โดย EZH2 มีบทบาทสำคัญในการควบคุมการแสดงออกของยีนผ่านกระบวนการเมทิลเลชันฮิสโตน การประยุกต์ใช้มีนัยสำคัญในการศึกษามะเร็ง โดยเฉพาะมะเร็งที่เกิดจาก EZH2 overexpression หรือการกลายพันธุ์ เช่น ชนิดของมะเร็งต่อมน้ำเหลือง (lymphomas) และเนื้องอกของแข็ง (solid tumors) บางประเภท การยับยั้ง EZH2 ช่วยให้นักวิจัยเข้าใจกลไก epigenetic ที่เป็นรากฐานของการเกิดมะเร็งและประเมินกลยุทธ์การรักษาที่เป็นไปได้ นอกจากนี้ ยังใช้ในการศึกษาก่อนคลินิกเพื่อประเมินประสิทธิภาพของการกำหนดเป้าหมาย EZH2 ในการรักษามะเร็งและสำรวจผลกระทบต่อโรคอื่นๆ ที่ได้รับอิทธิพลจากความผิดปกติทาง epigenetic