Basic Fuchsin ใช้อย่างแพร่หลายในสาขาชีววิทยาและการแพทย์เป็นสารย้อมสี ในจุลชีววิทยา เป็นส่วนประกอบหลักของสีย้อม Ziehl-Neelsen ซึ่งจำเป็นสำหรับการระบุแบคทีเรียทนกรด เช่น Mycobacterium tuberculosis ช่วยในการมองเห็นแบคทีเรียเหล่านี้ภายใต้กล้องจุลทรรศน์โดยให้สีแดงหรือชมพูที่แตกต่าง ใน histology ใช้ย้อมเนื้อเยื่อ โดยเฉพาะสำหรับเน้นคอลลาเจน เส้นใยกล้ามเนื้อ และโครงสร้างอื่นๆ ในศึกษาภายใต้กล้องจุลทรรศน์ นอกจากนี้ Basic Fuchsin ใช้ใน Schiff's reagent สำหรับตรวจจับอัลดีไฮด์ในสีย้อม Feulgen ซึ่งสำคัญสำหรับการระบุ DNA ในเซลล์ การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงอุตสาหกรรมสิ่งทอเป็นสีย้อมสำหรับผ้าและในการเตรียมหมึก