อะนิลีนบลู (ละลายในแอลกอฮอล์) ใช้กันอย่างแพร่หลายในการย้อมสีทางชีววิทยาและฮิสโตโลจี มีประสิทธิภาพสูงในการแยกแยะเนื้อเยื่อภายใต้การตรวจสอบด้วยกล้องจุลทรรศน์ ช่วยในการแสดงภาพโครงสร้างเซลล์ ในงานศึกษาทางพฤกษศาสตร์ ใช้ย้อมสีเนื้อเยื่อพืช ช่วยให้นักวิจัยวิเคราะห์ผนังเซลล์และส่วนประกอบอื่นๆ นอกจากนี้ ยังใช้ในจุลชีววิทยาเพื่อเพิ่มความเปรียบต่างของตัวอย่างแบคทีเรีย ทำให้ง่ายต่อการศึกษารูปร่างของมัน ความละลายในแอลกอฮอล์ทำให้เป็นตัวเลือกที่เหมาะสมสำหรับโปรโตคอลการย้อมสีเฉพาะที่ต้องการตัวทำละลายอินทรีย์