Basic Fuchsin ใช้กันอย่างแพร่หลายในเทคนิคการย้อมสีทางชีวภาพ โดยเฉพาะในจุลชีววิทยาและฮิสโตโลจี เป็นส่วนประกอบหลักในสีย้อม Ziehl-Neelsen ซึ่งจำเป็นสำหรับการระบุแบคทีเรียทนกรด เช่น Mycobacterium tuberculosis สีย้อมนี้ช่วยในการวินิจฉัยวัณโรคและการติดเชื้อที่เกี่ยวข้องอื่นๆ โดยการเน้นแบคทีเรียภายใต้กล้องจุลทรรศน์ นอกจากนี้ Basic Fuchsin ยังใช้ในตัวยา Schiff สำหรับสีย้อม Feulgen ซึ่งตรวจจับ DNA ในเนื้อเยื่อ ช่วยในการศึกษาของเซลล์และพันธุกรรม ยังใช้ในการย้อมสีแกรมเพื่อแยกแยะชนิดของแบคทีเรียตามคุณสมบัติของผนังเซลล์ นอกเหนือจากการย้อมสีแล้ว ยังมีการประยุกต์ใช้ในการย้อมสีสิ่งทอและเป็นสารให้สีในอุตสาหกรรมต่างๆ คุณสมบัติการจับตัวสูงกับกรดนิวคลีอิกและโปรตีนทำให้เป็นเครื่องมือที่มีค่าความสำคัญในห้องปฏิบัติการวิจัยและวินิจฉัย