เมทิลไวโอเลตถูกใช้อย่างแพร่หลายในหลายอุตสาหกรรมและงานวิจัย หนึ่งในการใช้งานหลักคือการเป็นสีย้อมในทางจุลชีววิทยา เพื่อช่วยในการย้อมสีและระบุชนิดของแบคทีเรีย โดยเฉพาะแกรม-บวกและแกรม-ลบ นอกจากนี้ยังใช้ในการย้อมสีเนื้อเยื่อในทางพยาธิวิทยาเพื่อช่วยในการวิเคราะห์ตัวอย่างทางชีวภาพ ในอุตสาหกรรมสิ่งทอ เมทิลไวโอเลตถูกใช้เป็นสีย้อมผ้าและเส้นใย เพื่อให้ได้สีม่วงที่สดใสและทนทาน นอกจากนี้ยังมีการใช้ในกระบวนการพิมพ์และทำหมึก ในทางเคมี เมทิลไวโอเลตถูกใช้เป็นอินดิเคเตอร์ในปฏิกิริยาเคมีบางประเภท โดยเฉพาะในการวัดค่า pH เนื่องจากสามารถเปลี่ยนสีได้ตามสภาพความเป็นกรด-เบส นอกจากนี้ยังมีการใช้เมทิลไวโอเลตในงานศิลปะและการศึกษา เพื่อเป็นส่วนประกอบในการสร้างสีและทำการทดลองทางวิทยาศาสตร์ในห้องเรียน