ใช้ในการย้อมเนื้อเยื่อในห้องปฏิบัติการพยาธิวิทยา เพื่อตรวจหาโพลีแซคคาไรด์และมูซินในชิ้นเนื้อเยื่อ PAS ย้อมไกลโคเจน, ไกลโคโปรตีน, และโปรติโอไกลแคนให้เป็นสีม่วงแดง ทำให้มีประโยชน์ในการระบุเยื่อฐาน, การสะสมของไกลโคเจน, และเชื้อรา Alcian blue เน้นโพลีแซคคาไรด์มูซินที่เป็นกรดและมูซินในเฉดสีน้ำเงิน ช่วยแยกแยะประเภทมูซินในเนื้อเยื่อบุผิว การย้อมร่วมกันของ PAS และ Alcian blue ช่วยให้เห็นคาร์โบไฮเดรตแบบเป็นกลางและแบบเป็นกรดพร้อมกัน โดยมักใช้ในการศึกษาทางเดินอาหาร, ปอด, และเนื้อเยื่อเกี่ยวพัน เพื่อประเมินการเปลี่ยนแปลงทางพยาธิ เช่น metaplasia หรือการผลิตมูซินในเนื้องอก