Aniline Blue, sodium salt ใช้กันอย่างแพร่หลายในเทคนิคการย้อมสีทางชีววิทยา โดยเฉพาะในเนื้อเยื่อวิทยาและจุลทรรศนศาสตร์ มันเป็นสีย้อมสำคัญสำหรับการเน้นเส้นใยคอลลาเจนในตัวอย่างเนื้อเยื่อ ช่วยให้นักวิจัยและนักพยาธิวิทยาสามารถแยกแยะโครงสร้างเนื้อเยื่อที่แตกต่างกันภายใต้กล้องจุลทรรศน์ สีย้อมนี้จับเฉพาะกับคอลลาเจน ให้ความเปรียบต่างที่ชัดเจนช่วยในการศึกษาข้อต่อเนื้อเยื่อและความผิดปกติของมัน

นอกจากการย้อมสีคอลลาเจน Aniline Blue ยังใช้ในชีววิทยาพืชเพื่อศึกษาความสามารถในการเป็นพ่อแม่ของเกสรและส่วนประกอบผนังเซลล์ มันช่วยในการระบุและวิเคราะห์การเจริญเติบโตของท่อเกสรและกระบวนการเซลล์อื่นๆ ในพืช ความสามารถของสีย้อมในการย้อมสีโครงสร้างเซลล์บางอย่างโดยเฉพาะทำให้เป็นเครื่องมือที่มีค่าทั้งในงานวิจัยทางการแพทย์และพฤกษศาสตร์