ออร์ซีนถูกใช้อย่างแพร่หลายในด้านจุลชีววิทยาและพยาธิวิทยาเพื่อการย้อมสีเนื้อเยื่อ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการย้อมสีเส้นใยอีลาสติกในเนื้อเยื่อเกี่ยวพัน ซึ่งช่วยให้สามารถมองเห็นโครงสร้างเหล่านี้ได้ชัดเจนภายใต้กล้องจุลทรรศน์ นอกจากนี้ยังใช้ในการย้อมสีโครโมโซมเพื่อการศึกษาด้านพันธุศาสตร์ และบางครั้งก็ใช้ในกระบวนการย้อมสีผ้าและเส้นใยธรรมชาติ ออร์ซีนยังมีบทบาทในการวิจัยทางวิทยาศาสตร์เพื่อศึกษาคุณสมบัติของเซลล์และเนื้อเยื่อต่าง ๆ