ซูดานแบล็กบี ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางเป็นสารย้อมสีทางชีววิทยาในด้านฮิสโทโลยีและไซโทโลยี เพื่อตรวจจับลิพิดในเนื้อเยื่อและเซลล์ มีประสิทธิภาพสูงในการย้อมสีฟอสโฟลิพิด ไลโปโปรตีน และไขมันอิ่มตัว ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าในการระบุโครงสร้างที่อุดมด้วยลิพิด เช่น ปลอกไมอีลินในเนื้อเยื่อประสาท ในด้านจุลชีววิทยา ใช้ย้อมสีเม็ดย่อยอาหารที่มีลิพิดในแบคทีเรีย เพื่อช่วยในการแยกแยะสายพันธุ์บางชนิด นอกจากนี้ ซูดานแบล็กบียังใช้ในด้านโลหิตวิทยาเพื่อย้อมสีเม็ดย่อยอาหารที่อุดมด้วยลิพิดในเม็ดเลือดขาว ช่วยในการวินิจฉัยโรคเช่น ลูคีเมีย ความสามารถในการจับกับลิพิดยังทำให้มีประโยชน์ในการศึกษาวิจัยที่มุ่งเน้นการเผาผลาญลิพิดและโรคที่เกี่ยวข้องกับการสะสม