Azure II eosinate ใช้เป็นสีย้อมในงานทางจุลชีววิทยาและพยาธิวิทยา โดยเฉพาะในการย้อมสีเนื้อเยื่อเพื่อศึกษาโครงสร้างของเซลล์และเนื้อเยื่อภายใต้กล้องจุลทรรศน์ มันช่วยให้สามารถแยกแยะส่วนต่าง ๆ ของเซลล์ได้ชัดเจนขึ้น โดยเฉพาะนิวเคลียสและไซโทพลาซึม นอกจากนี้ ยังมีการใช้ในงานวิจัยทางวิทยาศาสตร์เพื่อศึกษาการเปลี่ยนแปลงของเซลล์ในสภาวะต่าง ๆ เช่น การอักเสบหรือการเกิดมะเร็ง สีย้อมนี้ให้ผลการย้อมที่มีความคมชัดและแม่นยำ ทำให้เป็นที่นิยมในห้องปฏิบัติการทางวิทยาศาสตร์และการแพทย์