Azure A chloride ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการย้อมสีทางชีวภาพและทางพยาธิวิทยาเนื้อเยื่อ มีประสิทธิภาพโดยเฉพาะอย่างยิ่งในฐานะสีย้อมเมตาคโรมาติก ซึ่งช่วยในการแยกแยะเนื้อเยื่อและส่วนประกอบของเซลล์ภายใต้การตรวจสอบด้วยกล้องจุลทรรศน์ ในจุลชีววิทยา ช่วยในการระบุโครงสร้างเซลล์เฉพาะ เช่น เซลล์ mast และ mucopolysaccharides นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการวิจัยเพื่อศึกษากรดนิวคลีอิกและโครโมโซม โดยให้การมองเห็นที่ชัดเจนของวัสดุทางพันธุกรรม คุณสมบัติการย้อมสีทำให้มีคุณค่าในห้องปฏิบัติการวินิจฉัยสำหรับการวิเคราะห์ตัวอย่างเนื้อเยื่อและการตรวจหาความผิดปกติ