1,5-ไดไฮโดร-1,5-นาฟไธรีดีน-2,6-ไดโอน ถูกนำมาใช้เป็นหลักในสาขาเคมีเภสัชวิทยาในฐานะสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชภัณฑ์ต่างๆ โครงสร้างของมันมักถูกนำเข้าไปในโมเลกุลที่ออกแบบสำหรับการประยุกต์ใช้ทางบำบัด โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปที่มะเร็งและโรคติดเชื้อ นักวิจัยใช้โครงสร้างหลักของมันเพื่อสร้างตัวยับยั้งที่สามารถโต้ตอบกับเอนไซม์หรือโปรตีนเฉพาะที่เกี่ยวข้องในเส้นทางของโรค นอกจากนี้ ยังมีการสำรวจในการออกแบบสารประกอบชีวภาพใหม่เนื่องจากศักยภาพในการเพิ่มประสิทธิภาพและความเลือกสรรของยา บทบาทของมันในการสังเคราะห์อินทรีย์ยังขยายไปถึงการสร้างสารประกอบเฮเทอโรไซคลิกที่ซับซ้อน ซึ่งมีคุณค่าในทั้งการวิจัยทางวิชาการและการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรม